近年来吴兴区以保障防洪安全和排涝通畅，改善水生态环境，发挥河道综合功能为主要目标，积极创新河湖管护体制机制，并取得一定成效，呈现了三大特色。
      一是探索河道生态护岸建设新模式。为提升河道水环境、打造河道整治特色亮点，吴兴区水利局突出理念创新，采用生态技术建设生态河道。从生态角度出发，采用“松木桩”、“生态砌块”、“生态袋护坡”、“水生植物护坡”等先进生态环保技术进行河道建设（如在道场乡施家桥村沿山渠河道、东林镇泉庆村漾北小港采用了生态袋生态护坡技术，在高新区西金溇港等河道采用了水生植物护坡技术，在东金溇港、许溇港和杨溇港共5.24公里河道采用了松木桩技术），使河道除具备防洪功能外，还结合周边用地功能具备生态水体净化、河岸绿化的功能，实现了河岸与河道生态沟通的目的。目前共建设生态护岸38公里，共投入资金2700万元。
      二是创新河道保洁市场化运作机制。2015年，该区积极探索市场化长效保洁机制，投入财政资金92万元，通过政府购买服务和公开招标的方式，聘请湖州祥和物业公司、湖州嘉诚物业公司对东苕溪、长湖申、杭湖锡三条市级航道总计41.7公里实施长效保洁。同时，积极引导民间成立专业化河道保洁公司。目前，全区已成立了3家专业河道保洁公司，分别是高新区双丰河道保洁公司、湖州嘉诚河道保洁公司和汪洋河道保洁公司。其中双丰河道保洁公司采用市场化运作方式承包了高新区双丰、毛家桥、东桥、大溇四个行政村的河道保洁任务，实现了河道保洁力量的优化整合。通过市场化运作方式开展河道保洁，提高了保洁工作效率和标准，实现了河道保洁目标，得到了基层干群的一致好评。
     三是探索使用淤泥固化新技术。该区在西山漾清淤工程中，探索使用淤泥固化新技术，初步解决了淤泥处置难题。首先是采用“环保绞吸式吸淤船”工艺对西山漾实施底泥清淤扩容，然后带水淤泥经管道注入排泥场围堰中，再采用“真空预压法”进行淤泥固结处理。目前漾区清淤土方188万方，已完成清淤90万方，淤泥固化完成约60%，固化后的淤泥可作为花草种植土再次利用并建设成为草坪。